Công quốc bộ lạc Bayern thời trung cổ nằm ở vùng Đông Nam nước Đức ngày nay và hầu hết các vùng của Áo dọc theo sông Danube đến biên giới Hungary, sau đó chạy dọc theo nhánh sông Leitha ở phía đông. Nó bao gồm các vùng Altbayern của bang Bayern hiện đại, với các vùng đất của huyện biên giới Nordgau (Thượng Pfalz sau này), nhưng không có các vùng Schwaben và Franken. Việc Công quốc Carinthia bị chia cắt vào năm 976 dẫn đến việc mất các lãnh thổ rộng lớn ở phía Đông dãy Alps bao gồm các bang Kärnten và Steiermark ngày nay của Áo cũng như vùng phụ cận Carniolan thuộc Slovenia ngày nay. Phiên hầu quốc Áo — vùng tương ứng với bang Hạ Áo hiện nay — cũng chính thức trở thành một công quốc vào năm 1156.

Qua nhiều thế kỷ, một số lãnh thổ tiếp tục ly khai trong lãnh thổ của công quốc bộ lạc, chẳng hạn như Quận Tyrol hoặc Tòa Tổng Giám mục Salzburg, đã giành được vị trí trực thuộc Hoàng gia. Từ năm 1500, một số quốc gia trực thuộc hoàng gia này là thành viên của Vòng tròn Bayern của Đế chế La Mã Thần thánh.